Mercedes nacio en Rosario, Santa Fe el 01 de Enero de 1979 pero después de un tiempo, se fue a vivir con su familia a Buenos Aires. Allí a los 10 años convenció a sus padres de llevarla a un casting de un programa de televisión, donde fue aceptada y comenzó su carrera actoral en Superclán (1990) Al pasar los años Mercedes fue introduciéndose al mundo de la actuación, participando en teatro, musicales e infantiles. En 1994 participo en Nano, y gracias a eso pudo empezar a realizar participaciones importantes en Cebollitas (1997), y Gasoleros (1998), además en ese mismo año también participo en Muñeca brava. Más tarde en 1999 actuó en la película No muertos. Luego en 2000 grabo en las tiras Calientes e Ilusiones (compartidas) junto a Nicolás Vázquez, con quien se puso de novia y dos años después compartió vivienda. También participo en Son amores (2002). Y actuó en la pelicula Cautiva (2003). En el 2004 interpreto a Nora en Padre coraje. Para el año 2005 ella trabajaba en la obra El graduado y en ese mismo año Nicolas Vázquez le propuso casamiento. Durante el 2005 hizo participaciones en ¿Quién es el jefe? y Botines, y en el año 2006 en Juanita, la soltera. El 22 de abril de 2006 Funes le dio el sí a Vázquez en la iglesia Nuestra Señora del Guadalupe. En mayo de 2007 el matrimonio comenzó a tener conflictos llevando a que en agosto Vázquez abandone la vivienda. Un mes más tarde se publicaron unas fotos del actor junto a Gimena Accardi, poco después la relación fue confirmada. La noticia golpeo fuertemente a Mercedes llevándola a sesiones de terapia. En 2008 Funes interpreta a Leidi en B&B, durante su trabajo en aquella tira Mercedes solo salia de su camarin para grabar ya que no quería cruzarse con Accardi y Vázquez, los cuales actuaban en Casi ángeles, el cual también se filmaba en los estudios Pampa. Un tiempo después Mercedes empezó a salir con Fernando, un corredor de bolsas.En 2009 Mercedes formo parte del elenco de la obra de teatro 'Illia ¿Quién va a pagar todo esto?', también ese mismo año la actriz es convocada de nuevo por Cris Morena para interpretar a la jefa de ministros en la tercera temporada de Casi ángeles, personaje que continuó durante toda la cuarta temporada. En el 2011 Mercedes protagonizó el unipersonal 'Te voy a matar, mamá' y 'Los Fantasmas de la Patria' , paralelamente fué parte del elenco de 'Cuando me Sonreís'.